1990年7月，臺南下營出身的立法委員洪玉欽以聯合質詢方式，提出新科學園區設置地的議案討論。同年10月國科會正式報行政院建議設置新科學園區。1991年1月1日「國家建設六年計畫」中，正式將「擴建並新設科學工業園區」列入。此後，許多議員於針對南科園區周邊道路工程及開發進度一事，曾多次在議會中討論。
行政院國家科學委員會於1995年2月奉行政院決議設置「南部科學工業園區」，計畫範圍400公頃，即目前臺南科學工業園區第一期部分，位於今臺南市新市區、善化區、安定區間，同年5月核定籌設計畫。為配合園區開發時程及廠商建廠開工需要，1997年7月8日掛牌成立「臺南科學工業園區開發籌備處」。1998年6月5日，臺南市議員林宜瑾等人於議會中提出臨時動議，建請臺南縣議會成立「南科開發督導專案小組」，以確實監督臺南科學園區特定區之開發規劃，該議案決議通過。
2003年1月25日臺南科學工業園區開發籌備處升格更名為「南部科學工業園區管理局」，在2010年臺南縣、市合併後，成為帶動臺南高科技產業發展的火車頭。2019年12月11日組織法通過，再度改名為「科技部南部科學園區管理局」。

圖片為臺南市議會，《臺南市議會第十四屆第一次定期大會議事錄》，1998-6-5，頁119。

〈參考資料〉
臺南縣政府主計處統計科，《 南科設置對臺南縣地方發展影響分析》，臺南：臺南縣政府，2008。
臺南市議會，《臺南市議會第六屆第三次定期大會議事錄》，1998-6-5，頁119。